Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTNNB1P35222 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNB1P35222 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNNB1P35222 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms