Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HSPA4P34932 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HSPA4P34932 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms