Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM5P33992 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCM5P33992 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
MCM5P33992 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM5P33992 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM5P33992 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM5P33992 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM5P33992 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM5P33992 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM5P33992 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM5P33992 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM5P33992 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM5P33992 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM5P33992 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCM5P33992 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM5P33992 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM5P33992 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms