Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCD1P33897 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCD1P33897 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms