Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCKBRP32239 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCKBRP32239 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms