Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCKARP32238 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCKARP32238 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCKARP32238 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCKARP32238 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCKARP32238 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCKARP32238 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCKARP32238 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCKARP32238 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCKARP32238 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms