Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA9P31269 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms