Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMOD1P29536 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD1P29536 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD1P29536 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms