Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID4AP29374 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID4AP29374 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID4AP29374 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms