Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD38P28907 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD38P28907 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD38P28907 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD38P28907 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD38P28907 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD38P28907 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD38P28907 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CD38P28907 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD38P28907 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CD38P28907 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD38P28907 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD38P28907 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD38P28907 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD38P28907 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD38P28907 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD38P28907 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD38P28907 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD38P28907 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms