Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GABRB3P28472 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GABRB3P28472 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms