Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACADLP28330 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACADLP28330 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADLP28330 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADLP28330 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADLP28330 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADLP28330 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADLP28330 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADLP28330 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADLP28330 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADLP28330 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADLP28330 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADLP28330 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADLP28330 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms