Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTFP26441 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTFP26441 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFP26441 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFP26441 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFP26441 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFP26441 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTFP26441 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTFP26441 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTFP26441 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTFP26441 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNTFP26441 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNTFP26441 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms