Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSMA3P25788 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA3P25788 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms