Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCM3P25205 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCM3P25205 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3P25205 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3P25205 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3P25205 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3P25205 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCM3P25205 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCM3P25205 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCM3P25205 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
MCM3P25205 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCM3P25205 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCM3P25205 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCM3P25205 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms