Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCHP24723 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms