Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VAMP1P23763 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAMP1P23763 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms