Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
PTPRGP23470 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRGP23470 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRGP23470 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
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