Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCB4P21439 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCB4P21439 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCB4P21439 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms