Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNI1P19237 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNI1P19237 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI1P19237 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms