Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT15P19012 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT15P19012 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT15P19012 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT15P19012 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT15P19012 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT15P19012 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT15P19012 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT15P19012 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT15P19012 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT15P19012 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT15P19012 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT15P19012 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT15P19012 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT15P19012 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT15P19012 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms