Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL17P18621 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL17P18621 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL17P18621 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL17P18621 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL17P18621 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL17P18621 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL17P18621 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL17P18621 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL17P18621 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL17P18621 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL17P18621 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms