Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CEBPBP17676 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEBPBP17676 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms