Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB9P17482 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB9P17482 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms