Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMPD1P17405 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms