Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOT1P17174 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOT1P17174 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOT1P17174 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOT1P17174 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOT1P17174 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOT1P17174 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOT1P17174 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOT1P17174 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOT1P17174 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms