Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MUC1P15941 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MUC1P15941 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MUC1P15941 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MUC1P15941 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MUC1P15941 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MUC1P15941 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MUC1P15941 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MUC1P15941 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MUC1P15941 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MUC1P15941 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MUC1P15941 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MUC1P15941 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MUC1P15941 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MUC1P15941 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MUC1P15941 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MUC1P15941 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MUC1P15941 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MUC1P15941 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MUC1P15941 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MUC1P15941 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MUC1P15941 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MUC1P15941 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MUC1P15941 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms