Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HLA-EP13747 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HLA-EP13747 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms