Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCG2P13521 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCG2P13521 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCG2P13521 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCG2P13521 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCG2P13521 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCG2P13521 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG2P13521 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms