Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GP1BBP13224 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GP1BBP13224 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms