Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDH1P12830 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDH1P12830 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDH1P12830 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDH1P12830 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH1P12830 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH1P12830 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH1P12830 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH1P12830 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDH1P12830 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDH1P12830 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDH1P12830 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDH1P12830 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH1P12830 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH1P12830 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH1P12830 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDH1P12830 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms