Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP3P12645 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP3P12645 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP3P12645 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP3P12645 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP3P12645 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP3P12645 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP3P12645 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMP3P12645 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP3P12645 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP3P12645 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP3P12645 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP3P12645 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP3P12645 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP3P12645 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP3P12645 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP3P12645 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP3P12645 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP3P12645 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP3P12645 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BMP3P12645 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMP3P12645 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP3P12645 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP3P12645 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms