Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRFP11831 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRFP11831 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRFP11831 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRFP11831 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRFP11831 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRFP11831 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRFP11831 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRFP11831 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRFP11831 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRFP11831 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRFP11831 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRFP11831 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRFP11831 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRFP11831 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRFP11831 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRFP11831 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRFP11831 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRFP11831 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRFP11831 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRFP11831 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRFP11831 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRFP11831 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRFP11831 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRFP11831 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRFP11831 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRFP11831 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRFP11831 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRFP11831 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRFP11831 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRFP11831 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRFP11831 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRFP11831 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRFP11831 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRFP11831 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms