Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LAMC1P11047 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMC1P11047 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms