Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRFP10586 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms