Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HKR1P10072 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HKR1P10072 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HKR1P10072 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HKR1P10072 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms