Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC192P0DO97 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC192P0DO97 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms