Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGB3P0DN86 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CGB3P0DN86 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms