Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRGAP2BP0DMP2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRGAP2BP0DMP2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRGAP2BP0DMP2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms