Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms