Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC175P0C221 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms