Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXB5P09067 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms