Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP3A4P08684 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms