Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SRPRAP08240 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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