Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR3DP05423 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR3DP05423 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR3DP05423 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms