Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VTNP04004 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VTNP04004 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VTNP04004 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VTNP04004 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VTNP04004 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VTNP04004 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VTNP04004 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VTNP04004 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VTNP04004 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VTNP04004 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms