Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP1P03956 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP1P03956 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP1P03956 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP1P03956 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP1P03956 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MMP1P03956 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP1P03956 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP1P03956 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP1P03956 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms