Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOC2P02655 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOC2P02655 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOC2P02655 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOC2P02655 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOC2P02655 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOC2P02655 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOC2P02655 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOC2P02655 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC2P02655 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC2P02655 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC2P02655 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC2P02655 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC2P02655 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOC2P02655 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOC2P02655 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC2P02655 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC2P02655 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC2P02655 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC2P02655 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC2P02655 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC2P02655 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms