Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRBV12-3P01733 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRBV12-3P01733 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms