Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD3O95983 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MBD3O95983 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MBD3O95983 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD3O95983 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD3O95983 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD3O95983 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD3O95983 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3O95983 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3O95983 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3O95983 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3O95983 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3O95983 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3O95983 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MBD3O95983 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MBD3O95983 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms